作為推動新千年基礎科學研究的重要戰(zhàn)略步驟和作為知識創(chuàng)新工程中的一個試點，中國科學院于1999年11月27日成立了神經(jīng)科學研究所。神經(jīng)科學研究所致力于神經(jīng)科學基礎研究的各個領域，包括分子、細胞和發(fā)育神經(jīng)生物學、系統(tǒng)和認知神經(jīng)科學科學、以及腦疾病機理和診治手段研發(fā)。研究所的宗旨是建立一個現(xiàn)代化研究所的機制，提供一個有助于嚴謹科研工作，高效科研產(chǎn)出，良性科研合作的環(huán)境，實現(xiàn)以業(yè)績?yōu)闇实募詈唾Y助評估系統(tǒng)，以及為研究生和博士后提供高質(zhì)量的專業(yè)訓練。2014年起，神經(jīng)科學研究所在中國科學院體制與機制改革的框架下，成為中國科學院腦科學與智能技術卓越創(chuàng)新中心(簡稱中國科學院腦智卓越中心)的依托單位。腦智卓越中心是跨學科、跨院校的組織（見另一網(wǎng)站:http://www.cebsit.ac.cn/）,旨在凝聚中國科學院內(nèi)外的科研實力，通過團隊合作和學科交叉融合，解決在腦科學和類腦智能技術兩個前沿領域的重大問題。

　　神經(jīng)科學研究所目前擁有50個研究組，每個研究組由不超過五名的工作人員與數(shù)目不等的研究生和博士后組成。許多研究組與國內(nèi)外的同行有合作研究，長期合作者被聘為神經(jīng)所的客座研究員。中國科學院、國家科技部、基金委等對研究所的資助，使研究所研究人員的經(jīng)費和儀器設備已達到國際前沿機構的水平。由著名神經(jīng)科學家組成的國際顧問委員會和評審委員會，定期為神經(jīng)所的體制機制、科研工作提供建議，對提高研究所的整體科研水平起了積極的推動作用。

　　回顧神經(jīng)所20年來的發(fā)展，大致可以分三個時期：2000-2005間是“起步期”。在這個期間的主要目標是建立幾個高水平的實驗室，出一些高質(zhì)量的文章，建立嚴謹?shù)难芯繂T考評和研究生培養(yǎng)制度。2005-2015的十年可以說是“成長期”；基于起步期所建立的聲譽，我們能夠大幅度地招聘到一批優(yōu)秀的研究組長，拓展神經(jīng)所的研究領域，尤其是系統(tǒng)和認知神經(jīng)科學和非人靈長類研究領域。我們希望2016年以后的二十年是神經(jīng)所的“突破期”，在中國科學院腦智卓越中心的框架下，在幾個神經(jīng)科學的前沿領域做出國際領先的重大成果，包括繪制靈長類全腦介觀神經(jīng)聯(lián)接圖譜、闡明幾種高級認知功能的神經(jīng)環(huán)路工作原理、創(chuàng)建幾種重大腦疾病的獼猴模型和診斷與干預手段、類腦機器學習的新算法、閉環(huán)腦機接口的器件和系統(tǒng)等。有些基礎科學的創(chuàng)新發(fā)現(xiàn)是“可遇不可求”，但是上述的重大突破，是“有求才可遇”。有求的模式需要有明確的目標和里程碑，并能聚集多實驗室、多學科的力量以團隊模式攻關。神經(jīng)所在2017年底突破了體細胞克隆猴的生物技術難題，就是一個例子。

　　對大腦的結構和功能的理解是人類認識世界、認識自我的最終挑戰(zhàn)；神經(jīng)科學將是21世紀最活躍的前沿基礎學科。過去幾十年神經(jīng)科學研究在歐美發(fā)達國家發(fā)展迅速，在上海的中國科學院神經(jīng)科學研究所為中國神經(jīng)科學家提供了一個立足于本土，并與國際同行合作和平等競爭的機會。神經(jīng)所科研人員和學生的活力和熱情預示了中國神經(jīng)科學的未來是光明的。